基因頻率改變的原因有突變、選擇、遷移和遺傳漂移。
具體分析如下：
1、基因突變對(duì)改變?nèi)后w遺傳組成的作用有兩個(gè)方面。第一，它提供遺傳變異的最原始材料，沒有突變，則等位基因的重組和非等位基因的重組無從發(fā)生作用。第二，突變本身改變基因的頻率。
2、選擇是改變基因頻率的最重要因素，也是生物進(jìn)化的驅(qū)動(dòng)力量。從基因頻率改變的方向來看，選擇分為2種，一種是淘汰顯性個(gè)體，它能迅速改變?nèi)后w的基因頻率，使隱性基因頻率增加至1。另一種是淘汰隱性個(gè)體，使顯性基因增加。
3、遺傳漂移改變?nèi)后w基因頻率的作用方向是完全隨機(jī)的。遺傳漂移的作用大小因樣本群體的個(gè)體數(shù)不同而異。樣本愈小，基因頻率的隨機(jī)波動(dòng)愈大；樣本愈大，基因頻率改變的幅度愈小。
4、遷移對(duì)群體基因頻率改變量決定于遷移率和遷入群體基因頻率與接納群體基因頻率之差兩個(gè)因素。在遷入率一定時(shí)，基因頻率的變化與兩群體基因頻率之差成正比。
基因頻率是指在一個(gè)種群基因庫(kù)中，某個(gè)基因占全部等位基因數(shù)的比例。種群中某一基因位點(diǎn)上各種不同的基因頻率之和以及各種基因型頻率之和都等于1。