沙棘原漿主要的副作用是可能會引起胃部不適，通常要避免過量使用。
沙棘原漿中含有豐富的有機酸，長時間食用很可能會導(dǎo)致胃黏膜受到刺激損傷，會引起胃酸分泌增多，還會使胃部出現(xiàn)反酸和燒灼以及刺痛等多種的不良副作用，會對胃部的健康造成嚴重的影響。如果長期反復(fù)胃部不適，還可能會導(dǎo)致胃黏膜出現(xiàn)損傷或是潰瘍等多種的后果。
建議在醫(yī)師的指導(dǎo)下使用沙棘原漿，嚴格把控使用的時間、周期、劑量等，有利于防止出現(xiàn)副作用，提高藥物使用的安全性，以免影響身體健康。